Não existe nenhuma contradição!!! O que quer dizer é que se na fase S fossem formados cromossomas pela condensação de cromatina eles teriam no final dois cromatídeos cada um. Mas durante a interfase não ocorre a condensação da cromatina para formar cromossomas. Penso que a referência do livro serve para os alunos compreenderem que na fase S se duplica o DNA e portanto existem dois exemplares de cada molécula de DNA, o que se traduz em dois cromatídeos nos cromossomas.
Espero que compreendas! Se não diz qualquer coisa!